RAPTOR

기술

RAPTOR는 정확한 단백질 구조 예측을 위해 설계된 혁신적인 소프트웨어입니다. 하나의 통합 소프트웨어 솔루션에 고급 분석 도구를 결합하고 세 가지 스레딩 방법을 제공합니다. RAPTOR의 고유 한 정수 프로그래밍 최적화 접근 방식은 시퀀스 상 동성이 낮은 타겟의 구조 템플릿을 찾는 데 가장 효과적이며 고품질 모델을 생성 할 수 있습니다. 사용하기 쉬운 인터페이스와 이해하기 쉬운 E 값은 초보자와 전문가에게 이상적입니다. 무엇보다도 직관적 인 출력 표시를 통해 사용자는 결과를 한 눈에 쉽게 이해할 수 있습니다. 표적 단백질 서열이 주어 졌을 때 알려진 3D 구조를 가진 상동 단백질이 있다면 RAPTOR에서 제공하는 PSI-BLAST와 같은 서열 검색 도구를 사용하여 찾을 수 있습니다. 그런 다음 목표의 구조는 알려진 구조에서 빌드됩니다. 그러나 서열 상 동성이 중요하지 않은 경우 (예 : 25 % 미만) PSI-BLAST는 확실한 히트를 올릴 수 없습니다. 단순히 시퀀스 검색을 수행하는 PSI-BLAST와 달리 단백질 스레딩, 접기 인식은 상동 성과 구조 정보를 모두 사용합니다. 알려진 구조의 데이터베이스에 대해 알려지지 않은 구조의 단백질 서열을 스캔합니다. 스코어링 기능을 사용하고 3 차원 구조와 선형 단백질 서열 간의 호환성 분석을 수행함으로써 서열의 구조를 구축 할 최상의 구조 템플릿을 식별합니다. 결과적으로 단백질 스레딩은 한계 서열 상 동성이있을 때 상 동성 모델링보다 우수한 예측을 제공합니다.