FlexS

기술

FlexS는 다른 리간드에 대한 리간드 중 하나의 형태와 방향을 예측합니다. FlexS에서 reference-ligand는 경직된 것으로 가정하므로 bound state와 유사한 형태로 주어져야 합니다. FlexS의 중첩 알고리즘은 수동 개입이 거의 필요하지 않습니다. 단일 단계를 수동으로 수행하여 FlexS를 사용하여 이 지식을 계산에 통합할 수 있습니다. 따라서 FlexS는 리간드 쌍과 리간드 기반 가상 스크리닝에 대한 상호 작용 작업을 위해 설계되었습니다. FlexS의 두 가지 주요 애플리케이션은 리간드 슈퍼 포지셔닝(예: CoMFA/QSAR용) 및 가상 스크리닝입니다. 단백질과 이에 결합하는 작은 분자(참조 리간드라고 함)가 있지만 단백질 구조가 없는 경우 참조 구조를 활성 부위의 음성 지문으로 간주할 수 있습니다. FlexS는 테스트와 참조 구조를 정렬하여 유사성을 결정합니다. 가상 스크리닝에서 참조 리간드와 화합물 세트가 있고 실험 테스트를 위해 화합물의 우선 순위를 지정하는 데 관심이 있습니다.