CodonCode Aligner

기술

CodonCode Aligner는 DNA 서열 조립, 정렬, contig 편집 및 돌연변이 검출을 위한 사용자 친화적인 소프트웨어입니다. Aligner는 Phred-Phrap과 호환되며 시퀀스 품질 점수를 완벽하게 지원하는 동시에 친숙하고 배우기 쉬운 사용자 인터페이스를 제공합니다. 기능에는 텍스트 파일에서 시퀀스 가져오기, 추적에 대한 링크를 유지하면서 contig를 서로 정렬, 이형 접합 돌연변이 찾기, 관심 영역("기능") 정의, Phrap 생성 어셈블리 가져오기 및 편집, 시퀀스 및 기능 내보내기, 시퀀스 가져오기가 포함됩니다. ABI 및 SCF 파일에서 벡터 트리밍, 참조 시퀀스에 정렬, 이형 삽입 및 삭제 분석, 사용자 정의 기능 간 탐색, Consed 호환 어셈블리 프로젝트 내보내기.